As configurações do Apache SSL não têm nada a ver com o PHP "Transports de soquete de fluxo registrado". Simplificando, o TLSv1.1 e o 1.2 não são suportados pelo PHP 5.5. Atualize para o PHP 5.6 e você verá:
Transportes de soquete de fluxo registrados:
tcp, udp, unix, udg, ssl, sslv3, sslv2, tls, tlsv1.0, tlsv1.1, tlsv1.2