No seu arquivo de configuração do PHP-FPM, para as Definições do Conjunto, você pode ativar um "log lento" que pode fornecer mais informações sobre scripts PHP de longa execução:
; The log file for slow requests
; Default Value: not set
; Note: slowlog is mandatory if request_slowlog_timeout is set
;slowlog = log/$pool.log.slow
; The timeout for serving a single request after which a PHP backtrace will be
; dumped to the 'slowlog' file. A value of '0s' means 'off'.
; Available units: s(econds)(default), m(inutes), h(ours), or d(ays)
; Default Value: 0
;request_slowlog_timeout = 0
Descomente slowlog
e defina como um nome de arquivo válido, e descomente request_slowlog_timeout
e defina como 10s ou qualquer valor que você achar que seja muito longo, então recarregue / reinicie o PHP-FPM.