Se a unidade original foi uma partição com o Windows 7 e você não usou ferramentas de terceiros, é quase certo que esteja alinhada corretamente. Mas se você quiser saber, apenas inicialize um linux livecd e execute fdisk -l -u . Se a primeira partição começa em 2048 , então está tudo bem, se começar em 63 algo está bagunçado.