O Hyper-V no Windows Server 2008 R2 não tem suporte interno para cmdlets do PowerShell (há suporte interno para o Server 2012). Se você quiser usar o PS, precisará instalar a Biblioteca de Gerenciamento do PowerShell para o Hyper-V em Codeplex . Mesmo que não seja um produto oficial da Microsoft, eles coordenam seu desenvolvimento e geralmente é considerado seguro.
Usar remotamente o gerenciador do Hyper-V pode exigir que você execute algumas etapas adicionais (dependendo de como o servidor está configurado). O servidor e o domínio de gerenciamento de estações de trabalho estão associados? Você tem firewalls ativados?