Temos dois controladores de domínio no Windows 2008 R2 (migrados de 2003). A replicação funciona bem e tudo parece funcionar muito bem, mas percebemos que um dos controladores de domínio (e DNS) parece ignorar os encaminhadores condicionais dos nossos domínios de teste e perguntar diretamente ao DNS da Internet para obter valores diferentes do que deveria. Cada CD aponta um para o outro e para si mesmo e eles configuram os encaminhadores definidos como 8.8.8.8 e 8.8.4.4. Os encaminhadores condicionais são definidos para alguns endereços IP locais.
Eu já vi esse tipo de problema em 2003 ( link ), mas isso não acontece parece mencionar 2008 R2.
Acontece que um dos DCs tinha EnableDnsProbes definido para 1. Assim que eu defini-lo para 0 no cache limpo e reiniciado e DNS Server / NetLogon em ambos os controladores tudo parece resolver bem.
dnscmd /config /enableednsprobes 0
De acordo com o Artigo da Microsoft .