Para ressincronizar um mdadm RAID-1 (que, como você suspeita, é bloco a bloco, verificando uma unidade em relação à outra e replicando uma para a outra quando elas diferem), você pode fazer
echo "repair" > /sys/block/md0/md/sync_action
substituindo md1
, md2
, etc. por md0
conforme apropriado.
Embora eu não possa testificar, este patch do kernel de 2008 deixa bem claro me que isso também se destina a trabalhar para o RAID-5.