Se você quiser uma imagem mais direta e exata, você pode usar dd e netcat. Seria melhor se você pudesse colocar os servidores offline por um período enquanto faz essa operação. Se isso não for uma opção, você ainda pode fazer isso, mas precisará executar o fsck depois de terminar. Veja este artigo para mais informações:
Eu sugiro que você crie uma VM virtualbox com um disco 2% maior que a caixa que você está tentando capturar. este virtualbox Vm servirá como o "sistema de destino" descrito no artigo. Defina o modo de rede do Vm como ponte para que ele tenha seu próprio IP em sua rede. Inicialize esta VM a partir de um ISO, o meu favorito é o "Trinity Rescue Kit 3.4". Abra uma porta no seu roteador apontando para a vm para que o VPS possa se conectar.