Não, ele está pedindo os arquivos de instalação do Service Pack 2 , não do CD 2. Ele está pedindo o que precisa - as versões dos arquivos que já estão no sistema estão no SP2, mas a instalação arquivos de origem não estão lá por qualquer motivo.
Depois de fazer o que você está falando - essencialmente, forçando arquivos SP1 (2003 R2 fornecido com o SP1 incluído) no lugar do SP2 - você vai acabar com uma instalação do IIS em grande parte trabalhando, mas parcialmente quebrada. que não instalará pelo menos algumas atualizações de segurança corretamente.
Eu sugiro que você baixe e extraia os arquivos de instalação do SP2 para algum lugar acessível a partir deste computador, desinstale e reinstale o IIS na caixa com o local especificado quando ele solicitar o "CD" do SP2.
Se não, depois de ter forçado a passagem assim: a) reinstale o SP2 e b) execute o Windows Update novamente.
Editar: uma dessas quebras é a seguinte: link