Normalmente, você pode fazer isso ligando via "localhost" ( link ) em um navegador da Web.
Em um Navegador de arquivos, você pode obter acesso a esses arquivos abrindo as pastas com um navegador de arquivos com privilégios elevados. (para acesso de leitura / gravação) Tente Alt + F2 e gksudo nautilus , em seguida, pressione Ctrl + L e escreva /var/www e pressione Enter para ser direcionado para a pasta.
Depois de ler o seu comentário, editei esta resposta.
Não posso sugerir uma ferramenta como uma GUI completa para todos esses requisitos, mas você pode instalar serviços como:
phpMyAdmin
eXtplorer
(terceiro)
E alguns outros para gerenciar essas tarefas.
Para o caso da versão do Apache, você simplesmente executa um arquivo phpinfo.php com o próximo código dentro:
<?php
// Show all information, defaults to INFO_ALL
phpinfo();
?>
Esse arquivo é sugerido como sendo a própria raiz do /var/www e pode ser invocado ao excluir http://locahost/phpinfo.php no seu navegador da Web.
O /var/www é simplesmente a tela. Você pode preenchê-lo com qualquer ferramenta que desejar, incluindo o seu próprio site, mas, para produtividade, talvez queira incluir alguns serviços adicionais não públicos, como os que mencionei aqui.
Boa sorte!