Dê uma olhada no link . Pode ser liberado para o disco na maioria das vezes (caixa é 2% ocupada é uma strong dica para isso) Você pode, após uma análise cuidadosa, querer definir uma combinação de
innodb_support_xa = 0
innodb_flush_log_at_trx_commit = 0 # ou 2?
sync_binlog = 0
e veja o que acontece.
Uma vez que você recebe sua carga da CPU, então faz sentido usar o Win2008R2, algumas melhorias visam especificamente o Vista +