A escolha no site da Dell é apenas para lhe dar menos trabalho ao configurar as coisas e é puramente a questão de como você gostaria que seu servidor fosse. Se você escolher nenhum, você apenas terá que instalar o Windows e criar a partição.
Eu, por exemplo, não gosto de particionar, pois isso diminui o acesso à unidade e, em algum momento, há sempre a seguinte afirmação: 'Eu gostaria de ter feito a partição maior, o de 1GB livre não vai durar'. Considerando que o Windows 2008R2 leva cerca de 16gb e 32GB de memória RAM vai demorar cerca de 32gb de arquivo SWAP, você perderá o espaço em pouco tempo.
Ter uma partição para toda a unidade oferece algum benefício de velocidade, mas também como mencionado por LeoB significa que você não pode simplesmente reinstalar o servidor se isso acontecer (embora o servidor de formatação nunca seja fácil se você o executar no ambiente, então você teria que se preparar para isso de qualquer maneira, fazendo com que os dados de cópia não sejam um grande problema).