Em geral, esses são os ataques mais prováveis contra servidores IIS (esse talvez seja particularmente contra a vulnerabilidade do WebDav).
Se eu entendi corretamente, geralmente há o suficiente no começo para transbordar um buffer e o resto é shellcode para abrir o acesso ao sistema. Sistemas de detecção de invasão como o Snort podem detectar essas tentativas e rejeitar o envio antes de chegar ao servidor da Web.
Quanto ao Apache, você geralmente estará seguro, desde que tenha certeza de estar atualizado. Se você ficar de olho no log de acesso, verá muitos dos bots espalhados aleatoriamente tentando infectar outros servidores e disseminá-los ainda mais.