O Hyper-V pode inicializar a partir de qualquer coisa que o Windows possa inicializar. Então, sim, o Hyper-V pode inicializar a partir do SD, se o firmware puder fazer isso.
Mas muitas pessoas que estão interessadas em inicializar de um tipo de flash ou outro estão assumindo que você não quer fazer nenhuma operação de gravação nesse flash. O Hyper-V não tem nenhuma disposição para tornar o flash somente leitura ou para enviar gravações para alguma outra mídia. Essas coisas existem de terceiros e elas deveriam trabalhar com o Hyper-V, embora eu não as tenha experimentado pessoalmente.