O principal motivo para instalar em uma partição / disco não processado é a inicialização dupla, ou seja, usar como inicialização virtual ou dupla como uma unidade de inicialização. Eu duvido que você verá melhorias no desempenho usando partições brutas, talvez um pouco com discos brutos. Se você usa discos brutos, você precisa de unidades dedicadas, mas então seria melhor (se a velocidade fosse o principal problema) para distribuir as unidades no Linux e usar um disco virtual na faixa.
Se você estiver indo para dual boot você deve saber como instalar / reparar os carregadores de boot para windows e linux. A ordem de instalação não deve importar, apenas uma solução rápida para o respectivo gerenciador de inicialização que foi danificado, se necessário. Se você instalar o Windows primeiro, a maioria das distribuições do Linux o verão e instalará automaticamente uma entrada de menu para o Windows no menu do grub. Re-particionamento após a instalação do Windows não é necessário, a maioria das distribuições linux permitirá particionar durante a instalação.
Se estiver instalando para inicialização dupla, lembre-se de criar um perfil de hardware separado para janelas e um perfil de rede linux separado antes de iniciar os sistemas físicos existentes virtualizados. Isso manterá as alterações de hardware no mínimo.
Se você quiser dual boot com acesso virtual, minha preferência, embora use mais espaço, é também clonar os sistemas, físicos para virtuais. Em seguida, use o rsync para sincronizar / fazer backup dos físicos. Isso lhe dá um backup de seus sistemas como bônus. E não há problemas com perfis / drivers de hardware, exceto pela primeira importação de clones.
Ao inicializar o Windows, sincronize o linux físico para o Linux virtual e inicie o Linux virtual.
Ao inicializar o linux, sincronize as janelas físicas com as janelas virtuais e, em seguida, inicie as janelas virtuais.