Não vai limpar seu conteúdo. Normalmente, o Backup do Windows Server salva seus backups em uma pasta separada WindowsImageBackup que é criada na raiz do disco especificado.
No entanto, se você quiser fazer o backup em uma determinada pasta, poderá fazer a pasta de backup desejada para uma pasta compartilhada e executar um Backup do Windows Server em uma pasta compartilhada, em vez de um disco.
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Na página Especificar tipo de destino , selecione Fazer backup em uma pasta de rede compartilhada .
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Na página Especificar pasta compartilhada remota , digite o caminho para a pasta. Nesta pasta, uma pasta chamada WindowsImageBackup será criada. O backup que você criar será salvo em: \\\ WindowsImageBackup \.
Informações completas sobre como fazer isso podem ser encontradas aqui: link