Em top , 100% significa basicamente que o software está usando um núcleo de processador em tempo integral (ou n núcleos por 1/n do tempo cada).
Então, o que o top está dizendo é que o seu processo é multithread e usa mais de um núcleo da CPU ao mesmo tempo. Observe que esse número não diz nada sobre como o tempo de CPU usado pelo processo é distribuído sobre cada núcleo. Isso poderia significar dois núcleos e 60% cada ou 24 núcleos e 5% cada (dependendo do seu hardware, é claro).