Eu resolvi isso alterando o arquivo de manifesto relatado no erro ( C:\Program Files\Microsoft Office 15\root\office15\LYNC.EXE.MANIFEST
), alterando a arquitetura do processador da DLL UccApi.
Antes:
<assemblyIdentity type="win32" name="UccApi" version="15.0.0.0" processorArchitecture="*"></assemblyIdentity>
Depois:
<assemblyIdentity type="win32" name="UccApi" version="15.0.0.0" processorArchitecture="x86"></assemblyIdentity>