Você precisa conectar o disco compartilhado nos dois nós. Em seguida, você deve configurar e formatar o volume de compartilhamento em um dos dois nós: isso deve ser executado apenas no primeiro da VM do servidor de arquivos, não em ambos. No primeiro nó, inicialize o LUN iSCSI
O link a seguir é um guia passo a passo bem completo "Implantando um cluster de servidor de arquivos com incremento do Windows Server 2012 R2 usando VMs do Azure" que você deve ter em atenção: link
Só para ter certeza de que você está usando uma configuração suportada para o armazenamento. Você tem os seguintes pré-requisitos?
Suporte de software de servidor da Microsoft para máquinas virtuais do Microsoft Azure link
Requisitos para o cluster de failover do Windows Server com a VM do Azure Iaas: É necessário executar o Windows Server 2012 R2, o Windows Server 2012 e o Windows Server 2008 R2 Para o Windows Server 2012 e o Windows Server 2008 R2, o hotfix 2854082 deve estar instalado em todos os nós. Deve usar um recurso de endereço IP de cluster único. É necessário usar o armazenamento hospedado no Azure usando uma das seguintes opções: Replicação no nível do aplicativo para armazenamento não compartilhado | Replicação no nível de volume para armazenamento não compartilhado | ExpressRoute para armazenamento de bloco compartilhado de destino iSCSI remoto | Arquivos do Azure para armazenamento de arquivos compartilhados