Atualmente, você tem:
location / {
try_files $uri $uri/ /index.php?q=$request_uri;
}
na sua configuração do nginx para ativar o formato de link personalizado ... e isso funciona bem para permalinks, mas pode quebrar outras coisas.
Substitua por:
location / {
try_files $uri $uri/ /index.php?$args;
}
O index.php do Wordpress vai lidar com isso, então você ainda terá seus permalinks, mas não vai quebrar as coisas do jeito que você faria.