Tanto quanto eu sei, é o ambiente de terminal que lembra a senha por um determinado período de tempo.
Por exemplo, o comando
gksudo nautilus
no terminal pedirá a senha apenas uma vez em um determinado período de tempo. Enquanto o mesmo comando no launcher alt + f2 pede sempre.
De qualquer maneira, se você quer rodar algo como root, não é tão estranho perguntar a senha toda vez. Dessa forma, você sabe que estará executando o comando como root.