Seu arquivo php.ini está em / usr / local / lib? Isso é tão completamente errado, nenhum gerenciador de pacotes colocaria esse arquivo lá.
Você deve ter uma cópia do php localmente construída no seu host. which php
mostrará onde está. which -a php
mostrará todas as versões instaladas do php que estão no seu $ PATH.
Execute php -v
em cada um para ver qual versão é.
Remova as versões que você não quer, e você terá php 5.3 restantes. Se você não conseguir removê-los, altere seu $ PATH para que o que você deseja venha em primeiro lugar, por exemplo, PATH=/usr/bin:/usr/local/bin
se você quiser / usr / bin / php em vez de / usr / local / bin / php. Ou defina um alias de shell:
alias php=/usr/bin/php
e coloque-o em seus arquivos de inicialização do shell (~ / .bashrc ou ~ / .profile) para que essa versão sempre seja executada quando você digitar apenas php
.