O armazenamento da instância deve ser configurado antes de você iniciar a instância. Não há nada que você possa fazer enquanto o sistema está em execução.
Você tem duas opções e, seja qual for a opção escolhida, preste atenção na etapa em que configurou os volumes:
1) Se você não instalou nada substancial nesse servidor, jogue-o fora e crie um novo a partir do zero.
2) Caso contrário, crie um instantâneo a partir de seu volume do EBS, faça backup do conteúdo do seu efêmero e crie uma nova instância a partir do instantâneo.