Para o registro, o problema foi Plesk.
Provavelmente houve algum problema com a instalação manual do PHP 5 de Webtatic . Depois disso, qualquer novo subdomínio criado com o Plesk terá em sua configuração do Apache php_admin_flag engine off
.
Foi difícil descobrir onde estão, porque o Plesk cria um arquivo de configuração para cada [sub] domínio em um subdiretório conf
do diretório do domínio e os inclui em httpd.conf
. Essa é uma boa prática, mas difícil de encontrar e você não pode personalizá-la facilmente se quiser fazer algo diferente das opções de GUI (se você alterar alguma coisa via GUI, o arquivo conf antigo não será modificado, mas um novo será criado e você tem que reaplicar todas as suas modificações).