Não tenho certeza do que você está tentando alcançar aqui nem se o mysql tem um conceito de hosts confiáveis. Mas se você estiver fazendo isso por razões de segurança, faça isso no nível do usuário ao adicionar usuários no mysql. Em outras palavras, você terá que configurar um usuário no mysql que se conecte apenas a partir do servidor web, você pode fazer isso através do grant privileges options -
mysql> grant all privileges on *.* to [email protected] identified by 'password';
mysql> flush privileges;
Além disso, modifique suas regras de firewall para permitir conexões mysql, porta 3306, a partir de webserver.mydomain.com - Em iptables você pode fazer desta forma:
/sbin/iptables -I INPUT -s webserver-ip-address -p tcp --dport 3306 -j ACCEPT