Sugiro tentar configurar isso no WebSphere Application Server:
Usando o console administrativo, navegue até Servidores > Tipos de servidor > Servidores de Aplicativos do WebSphere > server_name > Infraestrutura de servidores > Java e gerenciamento de processos > Definição de Processo > Entradas de Ambiente
Lá você pode adicionar sua variável de ambiente. Observe que, se você estiver executando o aplicativo em cluster em vários servidores, precisará definir isso para todos eles.
Adicionar: também encontrei uma nota técnica explicando isso: link