Resposta curta: Não.
Longa Resposta:
O RemoteApp utiliza o protocolo de área de trabalho remota e, na verdade, executa uma sessão de área de trabalho remota completa sempre que um usuário abre o RemoteApp; ele apenas oculta a área de trabalho completa e fornece um contêiner no qual o aplicativo é executado. Então, tecnicamente, usando o RemoteApp você está usando o Remote Desktop.
Se você realmente deseja um aplicativo hospedado virtualizado ou remotamente, está pesquisando a tecnologia errada. Você realmente quer investigar o App-V . É uma tecnologia mais cara e saiu de uma empresa que a Microsoft comprou há alguns anos. Essencialmente, com essa tecnologia, o aplicativo é transmitido para o cliente à medida que bits e peças são necessários. Há também outras opções, como as ofertas que a Citrix oferece também.
Espero que ajude.
Editar:
Após uma pesquisa rápida, parece que também pode haver algum freeware disponível para fazer isso. No entanto, muitas pessoas simplesmente têm tarefas de login que chamam logoff.exe. Assim, quando um usuário tenta usar a área de trabalho remota, ele simplesmente faz uma chamada para fazer logoff imediatamente. Meio hacky, mas parece funcionar.