Apenas a única vez que você verá erros de FC em uma porta é se houver algo errado com o fio ou o HBA. Erros de ISL podem ser causados por problemas de configuração, mas você precisa saber como quebrá-los para ver isso, já que os padrões para todos os níveis de firmware atualmente suportados no Brocade serão seguros. Dito isso, além de comprar um dispositivo de teste projetado para ficar no caminho entre as portas do FC, você realmente não tem muitas opções.
Se você atualizar sua pergunta para explicar o que realmente está tentando fazer, posso editá-la para melhor responder.