Em seu smb.conf você pode especificar o parâmetro ' auth methods ', listando quais métodos de autenticação você deseja usar, como:
auth methods = guest sam winbind
Os parâmetros são lidos da esquerda para a direita; com o exemplo acima, o Samba tentará combinar o nome de usuário com o smbpasswd local primeiro antes de tentar corresponder ao AD.
Note que você pode querer substituir sam por sam_ignoredomain dependendo da sua versão do Samba e do formato do seu nome de usuário. Brinque com o que funciona para você.