De Guia de Programação do Módulo de Kernel do Linux seção 1.2.1.1:
A module compiled for one kernel won't load if you boot a different kernel unless you enable CONFIG_MODVERSIONS in the kernel.
Portanto, construir um kernel com CONFIG_MODVERSIONS habilitado provavelmente resolverá seu problema. Outra solução seria construir e instalar o Linux 2.6.32-33 com suporte ao PAE.