Munin parece ser o mais simples de instalar e configurar (verifique seu repositório de distro para pacotes), você também pode tentar também.
Eu estaria interessado em saber quais aplicativos web você conhece / usa que permitem monitorar o VPS. Eu gostaria de ter as seguintes métricas, CPU, memória, estatísticas de disco, estatísticas do Apache (hits / seg, agentes livres)
Obrigado
Com o "aplicativo da web", você quis dizer que está procurando um serviço de monitoramento de servidores hospedado gratuito?
Se você usa uma página da Web como agente para esses estatísticas internas, você pode usar qualquer um dos serviços de monitoramento de sites conhecidos com um plano gratuito (AlertFox, Pingdom, ...).