É mais provável que você peça para garantir que seu produto possa ser instalado sem a necessidade de interação do usuário. Como já é um msi, você não precisa se preocupar com nada a menos que tenha feito um trabalho muito ruim ao criar o msi e incluiu ações personalizadas que exibem diálogos separados que não podem ser desativados.
Basicamente, se você pode instalar o seu msi com opções silenciosas como / qn ou / qb e não precisar tocá-lo antes de fazer a instalação, você é de ouro .
* Edit: Eu só pensei em outra advertência. Se o seu aplicativo exigir ativação, o ideal é que a ativação tenha a opção de ser incluída como parte do processo de instalação. Na pior das hipóteses, deveria ser pelo menos possível pelos usuários finais com direitos limitados. Essencialmente, tudo o que seu aplicativo precisa de acesso elevado deve ter a capacidade de ser automatizado durante o processo de instalação.