O Rsync não obterá suas ACLs, mas você também pode usar um separado como icacls ou setacl para descarregar suas ACLs para um arquivo de texto que você possa usar quando precisar restaurar.
No momento, estou usando cwrsync para fazer backup de sistemas não críticos. Funciona bem. Eu estou puxando os backups para uma caixa Linux usando o dirvish que é um script perl para fazer backups com o rsync.
- Nenhuma das soluções rsync usa o privilégio de backup. Isso significa que eles não podem ignorar os acls do sistema de arquivos, e sua conta de serviço rsync deve ter pelo menos acesso de leitura a tudo
- Como mencionei no comentário, até que uma ferramenta rsync baseada no cygwin 1.7 seja lançada, você não terá suporte para arquivos em que o caminho inteiro seja maior que 260 caracteres.
- Você terá problemas com arquivos que possuem alguns caracteres unicode.