Eu encontrei muita documentação sobre como converter um arquivo .vmdk em um arquivo .vdi (VirtualBox). Mas todos eles assumem que você não usa instantâneos. - Existe uma maneira de converter os instantâneos vmdk também?
Acredito que eles possam estar usando formatos de armazenamento e algo incompatíveis "diferenciadores". Você provavelmente terá que examinar as especificações oficiais, ou o google para o software que faz isso.
Além disso, como um hack feio, vc pode descartar / mesclar esses snaps e usar várias v-machines (ou apenas fazer o backup como um arquivo, se seus snaps apenas tiverem algum estado inicial salvo)
Tem certeza de que precisa convertê-lo? O VirtualBox lerá arquivos vmdk muito bem.
Atualmente, as ferramentas de conversão virtual não convertem os instantâneos, AFAIK. Remova os instantâneos e use o vmdk diretamente ou converta-o em vdi. Ou clone usando o disco livecd ou ferramentas de clonagem de rede. O disco clonado não terá instantâneos, mas você não precisará remover os instantâneos do sistema existente.
Dicas de clonagem aqui - Como aumentar o tamanho de uma imagem de disco do VirtualBox