Parece estar relacionado ao BIOS: veja aqui e aqui .
Isso é codificado no gnome-settings-daemon e pode ser desativado em gconf, definindo
/apps/gnome_settings_daemon/plugins/xrandr/active
para falso. Esta solução alternativa provavelmente tem um efeito colateral desagradável de quebrar sua chave de troca de vídeo real, se você tiver uma.