Existem duas grandes diferenças entre as séries DS e FS, menos SSD local e menor quantidade de memória por núcleo, o que obviamente torna a série F mais barata. Então, se isso é um problema, vai depender da sua carga de trabalho.
Para o tamanho do SSD, isso só causará impacto se você usar o SSD local para paginação ou operações temporárias semelhantes. O desempenho da série D e F ao usar armazenamento premium para discos não temporários é exatamente o mesmo, portanto, é apenas o disco temporário que é um problema.
Para memória, você precisa olhar o perfil de memória de seus aplicativos e determinar se consegue lidar com a menor quantidade de memória ou não.
Como foi mencionado, você pode mudar facilmente entre FS e DS, então sua melhor aposta é fazer alguns testes de desempenho com seu aplicativo.