Eu tentei uma instalação do Azure AD Connect em um DC 2008R2 SP1 neste fim de semana e corri para exatamente o mesmo erro. Acabei de baixar esses dois itens:
Windows Management Framework 4.0 (que sei que você declarou que já fez o download e instalou):
Também baixei e instalei o .NET 4.5.1:
Acho que o truque que fez isso para mim foi instalar o Windows Updates e reinstalar o Windows Management Framework. Isso me fez passar pelo erro que você tem, mas então eu recebi a mensagem que o .NET 4.0 não estava instalado.
Depois de instalar o .NET 4.5.1, apliquei outra rodada de atualizações do Windows.
Ao fazer tudo isso, resolvi meu problema ao obter o Azure AD Connect após a mensagem de erro que você está tendo atualmente. Meu problema agora é que recebo esta mensagem no final da instalação:
"azure ad connect não é possível instalar o serviço de sincronização".
YMMV.