Parece que seu servidor ficou inativo por esses 45 minutos. Tente reiniciar o seu servidor:
/etc/init.d/apache2 restart
Se o problema persistir, tente uma reinicialização completa.
Se o problema sumiu, o apache pode ter travado - havia um bug no apache 2.2 (muito antigo, resolvido anos atrás link )
Se o problema persistir, Você tem uma imagem do sistema antes do colapso? Em caso afirmativo, a comparação dos arquivos de configuração pode nos informar se algo foi moderado com o seu servidor. Se você tem um servidor SSH, verifique
/var/log/auth.log
pode haver outros arquivos:
/var/log/auth.log.1
/var/log/auth.log.2.tgz etc
encontre aquele que contém o período de interesse e procure por algo suspeito lá.