Se eu olhar em um disco raiz do XEN Server 6.2 aqui, vejo que o disco tem apenas 4GB.
Possível solução:
Redimensionar arquivo de troca Eu fui através do disco e descobri que o arquivo de swap é de 512mb, que é de 12,5%. O arquivo de swap não está no meu caso em uso, então talvez você possa ajustá-lo para ser menor. Não basta excluí-lo em um ambiente de produção.
Não posso confirmar que a exclusão dos patches ajudará você.