Você pode usar Ctrl + Espaço para alternar o item selecionado na janela ativa Nautilus .
Você também pode usar Ctrl + Seta para a esquerda / Seta para a direita / Seta para cima / Down Seta para mudar / mover o item focado (arquivo ou pasta).
Como uma sidenote, esse processo é de alguma forma mais limpo com um diferente tema gtk do que o padrão (Ambiance) , o Os temas gtk do Numix , por exemplo, usam um ótimo esquema para destacar itens focados.
Espero que ajude.