Honestamente, eu não sei por 100% de certeza, mas baseado na experiência com o SBS08 ...
Event 91: Something to do with the Activity Directory Cert Service not being able to connect to the Active Directory. However after looking at the Microsoft tech support site this apparently is not really an issue as it is caused by the order services start in.
Eu suspeito que é realmente um problema. Todos esses serviços na mesma caixa começam às vezes em ordem de não-dependência e os avisos de certificados ... bem. Área de trabalho remota, seu site do SBS, etc., todos usam esses certificados. Por alguma razão, seus serviços de AD estão demorando mais para serem iniciados do que o normal, e seu serviço de Cert vem antes deles.
(Além disso, se o seu servidor SBS levar mais de 30 minutos para encerrar, bem, isso também é um problema de dependência de serviço. O Exchange tenta entrar em contato com o AD ao encerrar, mas o AD desliga primeiro. Mas eu divago.)
Para testar isso, tente reiniciar os serviços certificados, seguidos por todos os serviços mal-comportados (serviços de terminal, etc.) e veja se isso ajuda.
Minha primeira recomendação seria colocar um controlador de domínio de backup. Isso não apenas impediria que o serviço de certificação surgisse antes do AD, mas também é uma boa prática do ponto de vista da recuperação.
Exceto isso, você pode querer examinar os serviços de pedidos e começar a considerar se deseja ou não adulterar isso.