Com o OpenVPN, seus clientes VPN residiriam em um intervalo de endereços IP separado. Você pode configurar seus filtros para permitir esse intervalo para FTP ou colocar seu gateway OpenVPN atrás do firewall, permitindo acesso ilimitado aos clientes OpenVPN. Eu não recomendaria o último como você estaria desistindo de todo o controle, mas eu vi instalações fazendo exatamente isso por uma questão de simplicidade.