O problema era na verdade um problema NAT / portas - como o Filezilla estava usando o modo Passive, eu precisava abrir portas suficientes e dizer ao ProFTP quais portas estavam em uso.
Eu obtive a solução do link e segui os conselhos deles e abri os posts 60000: 65535 no firewall do CSF bem como adicionado
PassivePorts 60000 65535
para /etc/proftpd.conf, em seguida, reiniciou o firewall ProFTPd e CSF e funcionou - agora posso procurar diretórios, etc, como eu precisava.