Consegui corrigir esse problema sobrescrevendo meu machine.config
em C:\WINDOWS\Microsoft.NET\Framework\v2.0.50727\CONFIG
com machine.config.default
A diferença entre os 2 arquivos foi a seguinte 2 linhas foram extra no meu original machine.config
<section name="appSettings" type="System.Configuration.AppSettingsSection, System.Configuration, Version=2.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=b03f5f7f11d50a3a" restartOnExternalChanges="false" requirePermission="false"/>
<section name="connectionStrings" type="System.Configuration.ConnectionStringsSection, System.Configuration, Version=2.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=b03f5f7f11d50a3a" requirePermission="false"/>
Depois que essas linhas forem removidas, a instalação foi concluída.