keytool
é o comando que você está procurando para trabalhar com arquivos keystore Java. Ele é fornecido pelo Java JDK . (Você pode fazer isso com openssl
, mas eu não estou ciente disso.)
E para importar um certificado de CA raiz ou intermediário em um keystore:
keytool -import -trustcacerts -alias root -file cachain.crt -keystore keystore.jks
Para mais informações e exemplos: O Keystore Java Keytool mais comum Comandos