Você deve ser capaz de fazer algo com encontrar e testar, por exemplo,
find /path/to/search -type d \! -exec test -e '{}/myfolder' \; -print
ou
find /path/to/search -maxdepth 1 -type d \! -exec test -d '{}/myfolder' \; -print
é tarde, o vinho tem sido bom, o seu caso de uso não está claro - hic