Você simplesmente configura seu servidor como você disse. Faça as zonas locais onde você é "mestre" e configure encaminhadores DNS no bloco forwarders {} (normalmente em named.conf ou named.conf.options no debian por exemplo).
O servidor será autoritativo sobre as zonas locais, mas irá adiar todas as outras pesquisas para os servidores de nomes da Internet que você especificar no bloco de encaminhadores.