Se você estiver alterando as permissões na pasta pai ao adicionar o novo usuário, e se essas permissões forem herdadas pelas subpastas, isso será, na verdade, uma alteração e, assim, qualquer pasta cujas permissões forem alteradas será submetida a backup .
Em suma, se alguma permissão for alterada na pasta pai ou em qualquer uma das subpastas, essas pastas serão alteradas e sofrerão backup durante o backup diferencial.