Você precisará informar ao backup que não é possível fazer o backup dos arquivos SQL, pois não é possível restaurar os arquivos dos quais foi feito backup.
Em vez de executar o wbadmin start backup, use o wbadmin enable backup para agendar o backup. Isso lhe dá a opção de usar o parâmetro -exclude (você pode tentar usar isso com o backup inicial, mas acho que não funcionará).