Isso provavelmente significa que você está usando um certificado encadeado e não usou a diretiva SSLCACertificateFile /path/to/gd.bundle.crt. Godaddy, Starfield e alguns outros usam um arquivo .crt.
Editado: após alguns testes, consegui duplicar o erro usando o svn, conforme indicado em sua outra postagem, desabilitando o mecanismo SSL. Parece que você não tem https configurado para esse host / porta.
Na sua listagem virtualhost (isso pode ser automático, dependendo do painel de controle que você usa)
<VirtualHost 1.2.3.4:8443>
SSLEngine on
SSLCipherSuite ALL:!ADH:!EXPORT56:RC4+RSA:+HIGH:+MEDIUM:+LOW:+SSLv2:+EXP:+eNULL
SSLCertificateFile /etc/apache2/ssl/path.to.domain.crt
SSLCertificateKeyFile /etc/apache2/ssl/server.2048.key
Se você estiver usando a porta 8443, algo semelhante ao anterior seria ativado no SSL. Eu suspeito que parte da configuração esteja errada e enquanto sua diretiva Listen tiver a porta aberta, o mecanismo SSL não está habilitado para essa porta.