Adivinhando completamente: parece que ele pode não estar parando de forma limpa e, assim, passando por uma recuperação do InnoDB.
Forneça as 10 linhas de saída antes de reiniciar a corrente a partir do seu log do MySQL.
Editar 1
Obrigado pela informação adicional. Isso parece não ser o MySQL, mas o Windows. O que é especificado no serviço? Existe um script?
Editar 2
Eu interpretei mal anteriormente. Parece que há um atraso durante a inicialização do InnoDB, mas parece muito longo.
100322 10:30:01 InnoDB: Started; log sequence number 4 3854351346
100322 10:47:14 [Note] Event Scheduler: Loaded 0 events
Você está realmente usando o tablespace do InnoDB? show table status;
no seu banco de dados mostrará o motor. Se não, suspeito que a desativação irá acelerar o tempo de inicialização.
Editar 3
O Wordpress não aparece usando o InnoDB por padrão. Se você puder verificar que nenhum dos seus bancos de dados são InnoDB, adicionar skip-innodb
ao seu my.ini provavelmente aumentará a velocidade de inicialização.